輝瑞牽手IBM華生開發(fā)新藥
核心提示:最近輝瑞和IBM開始一個(gè)合作項(xiàng)目,將使用其智能軟件“華生新藥發(fā)現(xiàn)”幫助輝瑞尋找更好的免疫療法。
最近輝瑞和IBM開始一個(gè)合作項(xiàng)目,將使用其智能軟件“華生新藥發(fā)現(xiàn)”幫助輝瑞尋找更好的免疫療法。華生是一個(gè)智能搜索加工軟件,不僅可以快速搜索海量文獻(xiàn)(2500萬(wàn)摘要,100多萬(wàn)文章),更重要的是可以從這些文獻(xiàn)中提取智能信息。華生已經(jīng)有多個(gè)不同專業(yè)化版本,用于不同的領(lǐng)域如腫瘤基因測(cè)序。今天JAMA就有一篇文章介紹人工智能在診斷方面的應(yīng)用。但與輝瑞這個(gè)合作是人工智能第一次進(jìn)入新藥發(fā)現(xiàn)。
新藥研發(fā)高度復(fù)雜,所以不斷有新技術(shù)號(hào)稱能顯著提高研發(fā)效率。也正因?yàn)檫@個(gè)過(guò)程高度復(fù)雜,所以極少有任何單一技術(shù)能顯著提高總體效率。很多人聽到這個(gè)合作的第一反應(yīng)是“not again”,認(rèn)為這是和CADD、組合化學(xué)、各種組學(xué)一樣雷聲大雨點(diǎn)小。當(dāng)然這個(gè)看法有情可原,連設(shè)計(jì)合成路線這樣相對(duì)簡(jiǎn)單的任務(wù)現(xiàn)在計(jì)算機(jī)都難以戰(zhàn)勝優(yōu)秀的化學(xué)家,找新藥可能確實(shí)還有差距。但另一方面IBM深藍(lán)已經(jīng)是世界象棋第一高手,谷歌阿法狗去年也4:1擊敗圍棋頂級(jí)高手李世石。現(xiàn)在的人工智能已經(jīng)達(dá)到相當(dāng)水準(zhǔn)。
尋找新藥相關(guān)信息類似尋找民間高手。華生可能比人能更高效找到所有自封的民間高手,但卻不一定有能力從大量江湖術(shù)士中挑出少數(shù)真正高手。這是新藥研發(fā)和百科知識(shí)的關(guān)鍵不同。新藥相關(guān)研究魚目混雜,大部分無(wú)法重復(fù)。很多都是垃圾,而鑒別真?zhèn)尾皇怯?jì)算機(jī)長(zhǎng)項(xiàng)。另外也很難培訓(xùn)華生,因?yàn)樾滤幯邪l(fā)個(gè)體化嚴(yán)重。每個(gè)公司都有不同套路,同一公司不同科學(xué)家對(duì)同一問(wèn)題也看法不同。另外真正知識(shí)(所謂tacit knowledge)很少發(fā)表,多數(shù)公開發(fā)表的東西都是經(jīng)過(guò)包裝過(guò)的,只能誤導(dǎo)華生。最后真正有可能有突破潛力研究的一般發(fā)表在比較高端雜志,也會(huì)被高頻率引用。需要華生這樣超級(jí)軟件才能找到的研究極少會(huì)是很重要的。
但是華生也可能為新藥研發(fā)做出一定貢獻(xiàn),因?yàn)槿A生可以高效提供很多有幫助的線索。比如你的化合物出現(xiàn)PK/PD失聯(lián),華生可以告訴你有人在1982年報(bào)道一系列化合物和你的化合物有70%類似,但調(diào)控另一個(gè)靶點(diǎn)。這樣你可以更快找到可能的脫靶蛋白。或60年代有人在尋找免疫抑制劑時(shí)意外發(fā)現(xiàn)免疫激活作用,但當(dāng)時(shí)不知如何使用這些另類化合物。這些功能類似寫文章的同義詞提示,即使最優(yōu)秀的作家也可以從同義詞提示得到一些幫助。
今天最新統(tǒng)計(jì)大藥廠的內(nèi)部投入回報(bào)已經(jīng)降到3.7%這個(gè)幾乎不可持續(xù)的水平,所以任何能夠幫助提高研發(fā)效率的工具都是有益的。華生是根據(jù)IBM首任CEO Tom Watson命名,但是恰巧大偵探福爾摩斯的助手也叫華生(John Watson)。我們首先要把華生當(dāng)作助手而不是對(duì)手,華生短時(shí)間內(nèi)還不能取代Vagelos,做決定的還是科學(xué)家。
責(zé)任編輯:露兒
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